Los investigadores del Núcleo Básico Científico llevan a cabo proyectos en colaboración con otros grupos de investigación de instituciones nacionales e internacionales, entre los que destacan:
- Instituto de Energías Renovables - UNAM
- Sección de Electrónica del Estado Sólido - CINVESTAV
- Mesoamerican Centre for Theoretical Physics - MCTP
- Coordinación para la Innovación y Aplicación de la Ciencia y la Tecnología - UASLP
- University of Southern Denmark
- Centro de Ingeniería y Desarrollo Industrial - CIDESI
- University of Texas at Dallas - UTDallas
- CIEMAT - España
- Instituto Politécnico Nacional - ESIQIE-IPN
- Universidad del Istmo - UNISTMO
- Universidad Juárez Autónoma de Tabasco - UJAT
- Centro de Investigación en Materiales Avanzados - CIMAV-Chihuahua
- MICRONA - Universidad Veracruzana
- Benémerita Universidad Autónoma de Puebla - BUAP
- Universidad Autónoma de Baja California - UABC
- Tecnológico de México Campus Tuxtla Gutiérrez - ITTG
- Universidad Autónoma de Chiapas - UNACH